Első közelítéssel az innovációs járulék alapja megegyezik – az állandó jelleggel végzett iparűzési tevékenység után fizetendő – helyi iparűzési adó alapjával.
Tekintettel arra, hogy az iparűzési adó alapjának meghatározásakor többféle lehetőség közül is van mód választani, ezért fontos tisztázni, hogy ezek közül csak az általános adóalap meghatározás alkalmazható – az egyszerűsített nem. Az alap meghatározása azonban az innovációs járulék alanyainak nem fog többletfeladatot jelenteni, mivel ők az iparűzési adó alapjának egyszerűsített meghatározását úgysem alkalmazhatják s az iparűzési adó kötelezettség miatt annak alapját úgyis mindenképpen meg kell állapítaniuk.
Tekintve, hogy az innovációs járulékot nem a helyi adóhatóságoknak kell befizetni – hanem a központi költségvetésnek –, így a járulék megosztásának a fogalma – a helyi iparűzési adó megosztására vonatkozó szabályokkal szemben – nem ismert, így nem is kell ennek alkalmazási kényszerével sem számolni.
S kiegészítésül még egy apró egyszerűsítés: az ideiglenes iparűzési tevékenység után nem kell innovációs járulékot fizetni, szemben az iparűzési adóval.
